Мне пришло письмо на английском языке "Limit has been exceeded on domain...". Что это значит?

Это означает что у вас превышен лимит по дисковому пространству у этого домена.

Вы сами можете регулировать ограничения у доменов в рамках своих ограничений по тарифному плану.

Зайдите в панель управления хостингом:
Домашняя страница -> domain.ru -> Ограничения. В этом разделе можно выставить нужное количество дискового пространства для этого домена.

Детально посмотреть на что расходуется дисковое пространство можное в разделе Отчет:
Домашняя страница -> domain.ru -> Отчет.
В выпадающем меню можно выбрать "полный отчет" тогда будет показан размер каждого почтового ящика и каждой базы данных.

Дисковое пространство перерасчитывается один раз в день, поэтому после удаления файлов размер занимаемого дискового пространства изменится только на следующий день.